后來曾有學者仔細研究過“萬歷儒潮”的詳細過程，所有人都能清晰的感覺到其中有一支黑手在不停的推動。
從文廟喋血事件來看，原本張居正根本沒有想過要鬧這么大！調集軍隊的目的也只是抓捕、驅散為主。
但一名來自宣鎮的儒生柴吾希卻將整個矛盾徹底激化，他的父親，一名宣鎮的武將事后也遭到牽連。
整個事件的具體演變過程已經很難考證，每一個當事人說出來的話都截然不同。
幸存的儒生說，當時軍隊突然來了，一開始是對他們講話，要求他們返回家里。但是在領頭的幾人慫恿下，他們開始激烈的抗議。
幸存者們說，軍隊并沒有直接動手！在對天鳴槍示警后，開始有計劃的想要抓捕他們。
“軍隊沒有直接大屠殺，有過一些小沖突，但是并不是很激烈，但是當時局面很亂，跟隨而來的百姓們驚慌失措的到處亂跑”
這是一名幸存者后來在書里記載的內容。
但是有軍人卻說：“我們接到的命令是鎮壓，一切膽敢反抗者格殺勿論！”
當有人問及究竟是否沖儒生和老百姓開槍時，大部分軍人都異口同聲的說：“開了！”
但是偏偏被屠殺的人卻堅決否認軍人沖他們開過槍！
高層的軍官后來說，他們發布的命令很明確，只有驅散和抓捕，絕沒有屠殺這條命令！
高層軍官說的很直白，這件事太敏感，沒有人膽敢一次性屠殺這么多手無寸鐵的儒生！因此，他們始終表現的很克制。
然而親歷當時喋血事件的老百姓們卻說：“他們就像一群屠夫，剛剛喊過幾次話以后，就直接對著我們開槍！死了很多人，到處都是尸體！”
這是一場羅生門，究竟軍隊是否開槍，又是否殺了這么多人，已經無從得知。
甚至就連張居正和萬歷都有些疑惑，到底是否存在200余儒生喋血事件？
這里不得不說一下整個事件里最吊詭的地方，儒生死了200余人，但老百姓無一死亡！
按照堅持有屠殺事件發生的人的說辭，他們是被開槍打死的！事實上也證明。這些尸體的確是死于槍擊，而非冷兵器。
那么，在如此混亂的情況下，稍微遠一點就會失去準頭的火繩槍是如何做到這般精準的射擊的？
這是一個千古之謎！
京城已經戒嚴，甚至到了只許進不許出的程度。西苑也徹底被萬歷封鎖，只有張誠和張居正曾進過幾次。
事件還在繼續發酵！
明明京城在事件爆發后就徹底戒嚴，但消息還是向長了翅膀一樣迅速傳遍了周邊地方。
天津衛里，事件爆發后的第四天就引發了一次儒生集體游行事件！
許多人開始自發的向京城進發！
因此，當蕭平好不容易趕到京城外時，發現到處都是席地而坐的儒生和百姓！
口號喊的震天響，但如果抓住一個人詢問，卻會發現他們其實都不了解整個事件的經過。
甚至有人信誓旦旦的說，皇帝崇信妖仙，要徹底斷絕儒家道統，所以才實行了殘酷的“焚書坑儒”政策。
事后蕭大仙人曾了解到，宣鎮當時也鬧過一場亂子，但是很快被平息下來。
有人在帶節奏！
這是蕭平詢問過幾名“義士”后得出的結論！