黃巾賊的最后成功逃脫，讓杜旭重新開始冷靜分析，并給出了朱毅建議，不要再全部誅殺了。
朱毅仔細思考后，深以為然，是啊，漢軍對于黃巾賊的殺戮已經夠多了，黃巾恐怕已經沒有膽量敢和漢軍正面對抗了。
現在黃巾賊之所以不投降，主要愿意是，漢軍不留俘虜，如果不再全部誅殺呢？朱毅開始想象。
朱毅馬上開始直奔朱儁所在，但是，他還是來晚了，等到他來到朱儁身邊的時候，幾萬黃巾賊已經被殺戮殆盡了！鮮血染紅了整個大地。
朱儁認真的聽取了朱毅的建議，但是他沒有說話。
當夜，漢軍就地在神策營的軍帳中修整，一路的急行軍，然后緊接著而來的戰斗，哪怕是最精銳的漢軍，也已經疲憊不堪，漢軍需要修整。
而黃巾賊呢，逃竄的五千黃巾賊向四面八方逃竄，他們已經徹底失去了戰斗勇氣，但是，也有少量返回的宛城，并給城內的黃巾軍帶去了慘敗的消息，一時間城內人心惶惶！
南陽的漢軍在朱儁的帶領下，再次取得大捷，捷報直接傳入京城。
而河北戰場卻再次發生變故。
八月，皇甫嵩在蒼亭擊敗黃巾卜已部，擒獲卜已，屠殺七千多人。
這時，張角占據廣宗，控制河北腹地，盧植為宦官所誣，被召回，繼任的董卓被擊敗。于是朝廷下詔命皇甫嵩率兵進擊。
在這緊要關頭，張角病死，同時，南陽大捷的消息再次傳來，洛陽又開始一片歌舞升平！
九月，南陽漢軍主力再次圍困宛城，同時，河北漢軍主力在皇甫嵩的帶領下開始進攻廣宗。
隨著張角，波才，張曼成，這三人的相繼病死，失蹤，戰死，各地黃巾軍的士氣越來越低落，黃巾軍的敗亡已經不可阻擋。
黃巾軍的連續戰敗，數萬人被殺，進攻受挫，張曼成，趙弘兩位主帥的連續被殺，徹底擊垮了黃巾賊的，南陽黃巾賊的士氣低迷，在宛城的議事廳，最后，黃巾賊決定，在韓忠的帶領下向漢軍乞降，所以他們沒走。
當朱儁率領漢軍到達后，發現黃巾賊已經在準備投降了。
面對黃巾賊的變化，朱儁召集眾將，舉行軍議。
朱毅首先發言，“諸君，現在黃巾賊已經士氣全無，如果不允許他們投降，那我們就必將面臨無謂的傷亡，我認為這是完全沒必要的，我們的將士已經流血流夠了！”
張超、荊州刺史徐璆和南陽太守秦頡都認為可以接受，并且認同朱毅的主張，沒有必要再和黃巾賊死磕了。
但是他們的觀點卻遭到了孫堅的強烈反對。
“只有死掉的黃巾賊才是好的黃巾賊，現在黃巾賊士氣低落，毫無斗志，正是我們進攻完成的好時機！”
“如果現在放任他們投降，如果有一天，黃巾賊再次反叛，我們將如何對待？難道再來一次平叛么？”
“更重要的是，如果接受了黃巾賊的投降，就會給其他居心叵測之輩一個感覺
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，可以隨便造反，反正最后可以投降，只要投降就能保住性命，就隨便造反吧！這會讓大漢永無寧日！”
兩相比較之下，最終朱儁決定采納孫堅的意見，拒絕黃巾賊投降，再次圍城。