如此陳吊眼稱王自立的事情也為行朝所知再掀波瀾，朝中眾臣紛紛上書，或要求對叛逆予以剿滅，或請求對此部義勇予以招安。趙昺發現朝中眾臣對待此事的態度有些微妙。
主張對陳吊眼這幫逆賊予以剿滅的卻是一班文臣，他們以為陳吊眼身為大宋子民不思報國，卻趁國事衰微之機，聚眾建國自立，不奉天朝正朔為主，實乃大宋的叛逆。若不及時將他們清除，各地亂民將紛紛效仿，則會妨礙復國大業。
而一向主戰的武臣們則對出兵征剿陳吊眼持反對態度，以為他們雖然自立，卻并未奉蒙元為主，而是打著反元的旗號，這正與朝廷相合。朝廷可予以敕封招安，將這支反元力量收為己用，作為來日復國之戰的助力，卻不是跨海征剿，徒耗軍力和錢糧，那樣只會助紂為虐。
對于如雪片般的奏疏趙昺卻全部壓下，未置可否。他清楚文臣們要求清剿陳吊眼，一者是在這局勢微妙的時刻表明己方堅決維護朝廷正朔的決心；二者他們從心里還是對陳吊眼這些亂民有提防之心，怕其投靠蒙元，轉而對行朝不利。而武人們則沒有那么多的花花腸子，一切從實際出發，一者陳吊眼曾助宋軍攻打泉州，尚有袍澤情分；二者軍中兵丁半數以上為義勇出身，自己去打他們不免有兔死狐悲之感。
現在是軍改深化之際，趙昺當然不肯出兵，且自己也早有安排，因此只向幾位宰執通報了自己掌握的情況，讓他們壓下此事，當然他在其中的布置秘而不宣，以防泄密導致事敗害了許夫人，更破壞了自己的大計。事實上事務局在陳吊眼起事之前已經聯絡上了許夫人，不出趙昺所料其還是心向朝廷的，且又得到幼弟的消息自然驚喜不已，對于小皇帝的報恩之舉更是感恩涕零，立誓效忠陛下。
八月十五日夜晚，陳吊眼率聯軍乘機再次突襲漳州城。這次率軍進城，守城的元軍十有八九被殺，陳吊眼軍威大振，兵員猛增聚眾十萬。而許夫人在攻打漳州的戰斗中，獲得大批武器甲仗的武裝，又有精兵相助，其統領的義軍自然如虎添翼率先攻入城中，分得了最大的一塊蛋糕不說，兵力也暴增到三萬之眾。
其后忽必烈獲知漳州再次失陷損兵慘重的消息后勃然大怒，命高興在建寧府設立行都元帥進行鎮壓，又命完者都為鎮國上將軍福建等處征蠻都元帥，領兵五千與高興會合。重兵威逼之下，陳吊眼領軍退出漳州城返回云霄一帶山中結寨五十余憑險據守，以王命號令群雄。
這次元軍卻沒有出兵攻打兵力強盛的陳吊眼，完者都率軍進入福建后，先用大軍鎮壓政和的黃華義軍，并賄以重金，以征蠻副元帥重職招降。果如趙昺所料，黃華沒有經受的住考驗投降了蒙元，因為趙昺已有準備在獲知消息后，立刻通知潛伏在黃華軍中的探子率軍萬余出走投靠許夫人，并與黃華部脫離向廣東鳳凰山一帶轉進，避開敵鋒芒的同時，接受補給，進行整訓，建立根據地。
而元軍利用黃華熟悉福建山區作戰的特點，命黃華為前驅清剿漳州陳吊眼抗元起義軍，其熟悉義軍山寨作戰的特點，帶領元軍步步進逼。黃華的投降，許夫人的撤離，使義軍聯盟破裂，南北難以相互呼應，而黃華熟悉山地作戰特點，又知陳吊眼虛實，在其協助下陳吊眼被連破數寨。
陳吊眼分兵駐守拒敵，以其叔陳桂龍駐九層漈，自領一部駐漳浦峰山砦，陳三官駐水篆畬，羅半天駐梅龍長窖，陳大婦駐客寨畬。他們憑借險要的地形扼險固守，一時間使元軍無法突破，反而遭到重大傷亡，現在戰局暫時陷入僵局，兩軍各自結寨對峙。