“馬丁”號的遭遇也僅僅只是這次西班牙艦隊戰損狀況的一個縮影，四十多艘戰船有四分之一被永久地留在了三亞近海，另外還有十艘補給船也未能跟隨艦隊一同脫離戰場，算下來竟有二十多條船折在這一戰中，損失的人手估計。
在沖鋒期間更靠近海岸線的美洲艦隊損失更為慘重一些，特別是排水量五百噸以上的大帆船，完全成了岸防火力的重點打擊目標。美洲艦隊所屬的八艘超過五百噸的大船，僅有三艘成功脫逃，而包括“馬丁”號在內的五艘武裝帆船都未能幸免成為了海漢的炮下亡魂。
路易斯率領的馬尼拉艦隊雖然狀況稍好一些，但也僅僅只是被海漢摧毀的船只數目少了幾艘而已，戰損情況依然不容樂觀，就連他的旗艦“圣迭戈”號的側舷也是彈痕累累，被炮彈打出了五六處醒目的大洞。萬幸船上的火藥沒有被擊中引發爆炸，而這些彈著點也比吃水線高出不少，倒是不會有進水傾覆之虞。
整個西班牙艦隊幾乎沒有任何一艘船是完好無損地撤下來，絕大多數船只在回到馬尼拉之后都得立刻進行修繕工作。不過兩名指揮官現在要考慮的并非修復這些帆船需要花費多少錢，而是該如何向馬尼拉總督阿拉貢內斯說明這次與海漢交戰的實際狀況。堂堂的西班牙艦隊遠征海漢，結果被對手在家門口揍得灰頭土臉，險些連逃都逃不出來，這樣的戰績要如何交代才說得過去
西班牙艦隊上一次在戰斗中損失如此之大，還是在列強紛爭的歐洲戰場上，在遠東地區可從未吃過這么大的虧。這件事別說兩名指揮官，就算是加上馬尼拉總督，也未必扛得下來這份責任。為今之計，也只能先帶著殘余人馬趕回馬尼拉，再與阿拉貢內斯一同合計該如何把這個消息報回國內。但不管如何，兩名主要當事人的責任估計是推不掉了，他們的帶兵生涯也很有可能會在這一次大敗之后被畫上句號。
海漢這邊收兵回營，自然也是要統計一番自家的折損狀況。相比被打的七零八落的西班牙艦隊，海漢海軍在這兩天交戰中的損失就顯得極為有限了，雖然有十來艘戰艦都或輕或重的掛了彩，但真正損毀比較嚴重的只有三艘戰艦，也都還在可以修復的程度，只是回港之后肯定得馬上送進干船塢接受大修了。
而人員方面的折損就讓軍方不免有些肉疼了，截止目前陣亡與失蹤的人員已經統計到四十余人，其中甚至還包括了數名海軍高級軍官，而且這個數字很可能還并不是最終的結果，因為還有不少參加戰斗的船只尚未完成人員統計。盡管海軍在裝備和戰術方面都具有明顯的優勢，但在這種以炮擊為主要攻擊手段的海上混戰中依然不可避免地出現了大量傷亡是的沒錯，對于海漢軍來說，一次戰斗中傷亡超過二十人就可以定義為“大量”了。
雖然看著幾十人的數字不大，但海漢士兵的培訓成本和周期遠非這個時代的普通水兵可比，能夠在船上擔任指揮職務的軍官更是需要經過數年的服役，才能積累到足夠的經驗獲得晉升機會。因此對于海漢海軍來說，這些傷亡可不僅僅只是一串冷冰冰的數字而已，戰死者所遺留下來的戰斗位置，也未必是后來人可以馬上填補的。這幾十個人的空缺，或許就得需要招募十倍甚至幾十倍的水兵，才能選拔出足夠的合格者來頂替。
而對于交戰海域及附近海岸的搜索，可能還將持續三到五天，以確保包括西班牙船員在內的所有生還者都能被及時發現。這當然主要是出于安全方面的考慮，以避免有在交戰時落水的西班牙人偷偷泅渡上岸之后制造出更多的麻煩。不過后續的搜索工作倒也不用完全依賴軍方來進行，屆時會調動一部分民兵代為執行這種費時費力的任務。