這些參謀大部分都是從基層軍官中選拔出來，有一定文化基礎和實戰經驗的年輕軍官，他們都在三亞的陸軍學院接受過指揮專業的進修培訓，而能夠有機會在實戰中聽到高橋南這種經驗豐富的名將分析戰局，對他們來說都是非常難得的經歷。
平戶是日本最重要的貿易港之一，這里的時局是否太平，會對整個日本國的海貿狀況產生直接影響。而平戶藩一直以來堅持花大力氣建設水軍部隊，目的之一也是為了保證這地方的太平。但不管平戶藩軍怎么練兵，他們顯然不太可能在自家的城區內操練巷戰，那樣除了干擾本地的貿易環境，更有可能會引發民眾的恐慌情緒。
高橋南正是判斷到了這一點，所以他認為對手的抵抗作戰缺乏指揮調度的原因，是無法對這個特殊作戰環境提前備戰所致。而這里雖然對特戰團來說是一個陌生環境，但部隊完全可以憑借過去積累的城區巷戰經驗，來對付這些散布于城內各個地方的烏合之眾。
“如何對付城區作戰環境下的這種小股敵人，我想你們在進修的時候都已經學習過相應的戰術，穿插、切割、包圍、殲滅去給你們負責的部隊下達作戰命令吧，我們要在天黑之前盡量完成對城區的控制至少，要先配合海軍把港口區域占領下來，這樣我們才能就近獲得補給。”高橋南再一次向作戰參謀們強調了接下來的主攻方向。
在這場攻打城區的作戰中，每一名參謀負責一個連隊的行動，收集整理相關的戰報，同時向其傳達指揮部的最新作戰指令。這些命令并不都是由高橋南親自下達，他現在只需要確定大的策略和方向，而具體的指令則是由這些參謀軍官們制定和分發，再由一線的部隊負責執行。
這樣的作戰方式讓指揮部與前線之間的信息交換保持高效，同時指揮官也能把注意力更多地放在整個戰局的走向上，而不是花費大量精力去對每一個班排連進行微操指揮。
而參謀部門除了能夠提升指揮部的運作效率之外，同時也是在培養一批擁有協同指揮能力的高級軍官。這些軍官在積累了一定的經驗之后，大多又會再次回到作戰部隊，擔任連營級別的指揮官。
命令很快就從指揮部傳達到了一線的作戰部隊，而這個時候其實交戰的火線已經推進到了港區的南端，離港口碼頭也就一條街了。
不過平戶城舊址，藩主府邸和部分家臣的宅邸，也都集中在港區南側的臨海高地上，而海漢軍認為這塊高地上可能集中了平戶剩余抵抗力量的大部分，因此并未急于對這塊區域發動攻擊，而是先繞過這個地方，攻打修筑了大量岸防工事的港口。
這個時候由盧元龍指揮的港口防區其實已經失去了大部分的作戰能力，只剩下大約四五門炮還能繼續對海上開火。然而這些沉重的火炮一時半會兒都難以掉轉方向，而且港口外便是一整支武裝艦隊在虎視眈眈，隨時可能發起登陸行動，盧元龍因此也不敢下令讓人將這幾門炮調轉炮口先對付陸上攻過來的敵人。
事實上盧元龍很清楚，不管是陸上還是海上，只要讓其中一路敵軍攻占了港口，平戶就可以說鐵定會失陷了。但隨著交火的槍聲離港口越來越近，盧元龍的心也在一點一點往下沉，他知道最后的時刻就快要來了，自己所負責守衛的這塊區域上就會面臨海漢軍的正面進攻。
田川介發出的最后一條作戰命令在一個時辰前送達了他這里，沒有手令，僅僅只是一個口信，命令他率部死守港口，如果最終仍是失陷，可向北邊的山林撤退。
在當初天草四郎泅渡上岸的田助灣以北，平戶島的最北端，是面積大約六七平方公里的山林地帶，這塊區域內定居的民眾不多，基本全是原始森林，因此也是被田川介視作了最后還能撤退的方向。前日悄悄送走田川七左衛門，便是穿過這片山林去到島北海岸上的一處秘密地點，讓平戶水軍的船將其接走的。
盧元龍明白田川介要求自己死守港口的目的，是為了給其他人向北撤出爭取更多的時間。等敵軍攻陷港口再撤，那肯定已經走不了了。但他即便知道這一點，也并不打算放棄港口提前逃跑，而是決定在這里跟海漢人來一個徹底的了斷。