西班牙人占據的雞籠、淡水被首先否決。盡管雞籠附近有豐富的礦產資源，有著名的基隆煤礦和金瓜石金銅礦，但是開發難度很大，而且地理環境極其惡劣。需要投入大量的人力物力進行整治。
當時人的記載對此地也無好評：“雞籠(Kelang)及淡水(Tansoei)并非優良之碇泊地,加上附近之番人兇惡,無法交往。”、“君不聞雞籠、淡水水土之惡乎？人至即病，病輒死。凡隸役聞雞籠、淡水之遣，皆欷歔悲嘆,如使絕域；水師例春秋更戍，以得生還為幸。彼健兒役隸且然,君奚堪此。”
雞籠、淡水都位于臺灣北部,這里是全島降水最豐富的區域,每年降水量在3000毫米以上。在通常年份,臺北有半年時間都在下雨。雨水過多的區域有利于植物和微生物生長,但不利于人類。因而明清時期的福建人將臺北稱為瘴癘之地,移民在當地的死亡率很高。把中轉地基設在這里，死亡率是可想而知了。
臺灣北部在1694年還有一次大地震。強度之大直接在臺北盆地內震出了一個30平方公里的臺北湖。無論從哪個角度來看，臺北地區都不是穿越眾應該涉足的地點。
花蓮也得到了很多人的支持。花蓮的優勢是安全性極高。它偏處臺灣東部，與臺灣島的其他地方又山脈阻隔。周圍地形險峻，大多數地區都不適合船舶停靠，沿岸大多是非常陡峭的海岸地形，只有河口有停船的地形。只要在河口建立基地，從其他地方根本無法登陸。歷史上花蓮在1932年公路通車前與臺灣其他地區的聯系只能靠船運，被稱為臺灣的“陸上離島”。整個17世紀，除了1622年西班牙去過花蓮采砂金之外，沒有人對這塊地方感興趣。
花蓮礦產資源比較豐富，其中穿越者能立即開采的有三種：硅酸鹽的蛇紋石石棉礦，大理石、石灰石。花蓮到21世紀都是臺灣最重要的水泥產地。可以做出高標號的水泥就地供應開發臺灣。當地還有少量的鐵礦，儲量不大，但是開采容易。另外花蓮的蛇紋石礦有不少都伴生鉻鐵礦磁鐵礦還有鋁鎂。花蓮的地表當時應該除煤礦外都或多或少的有零星分布，很適合臨高這種規模小的集團去發展開采。
淡水資源上，花蓮有三條比較大的河，有不少面積不算小的沖擊平原，去種地發展農業也有一定的潛力。
但是最后，花蓮的雨水過多使得此地落選了。雨水過多造成當地的環境不適合大規模移民。日踞臺灣期間曾經打算向花蓮移民建立農業屯墾區，最后因為氣候和疾病的關系最終失敗。
最后列入考慮的就是屏東、高雄一帶了。此地正在臺灣島相對適宜居住和農業耕種的臺南平原上，高雄有港口，盡管當時的港口未經過整治，無法停泊大船，但是停泊千噸級以下的帆船還是能做到的。