五月，朝廷任命永樂少府荊州南陽郡魯陽縣人樊陵為太尉。
樊陵乃順帝時著名隱士樊英之孫。據傳樊陵和曹嵩均為買官得到太尉的職位。樊陵與宦官交好。
六月丙寅日公元188年7月27日，司隸遭遇罕見的大風。
太尉樊陵罷免，又轉任京兆尹，接替生病的李受。
益州刺史司隸河南尹偃師縣人郤儉在益州貪贓枉法、暴虐害民、天怒人怨。
荊州南陽郡人馬相，自號黃巾，與趙詆、王饒、趙播等一、二日內合聚益州疲役之民數千人，先殺綿竹令李升，吏民攏集，合眾萬余人，攻破廣漢郡雒縣，殺死益州刺史司隸河南尹偃師縣人郤儉。
郤儉善養身之道辟谷和餌伏苓。
數月內，破壞廣漢、蜀郡、犍為三郡，馬相自稱“天子”，眾至數萬人，遣兵破巴郡，殺巴郡太守趙部。
蜀郡張魯和巴郡張修響應，馬相稱天子高于系帥張魯，張魯和張修退出。
御史中丞冀州勃海郡南皮縣人張納接任巴郡太守，治書侍御史韓馥升任御史中丞。
益州從事賈龍與益州犍為太守任岐領兵數百人在犍為郡東界，攝斂吏民，得千余人，攻馬相等，數日破馬相軍，斬馬相等，平定益州，州界清靜。
賈龍選吏卒迎接來益州任益州牧的劉焉。據傳犍為太守任岐并不支持賈龍迎接劉焉。
之前，馬相起事，去益州的道路不通，劉焉停留在荊州與益州邊界上。
劉焉設益州州府治所在綿竹，撫納離叛之民，施寬惠政務，收買人心。
劉焉任命跟隨劉焉入益州的辭官侍中董扶出任蜀郡屬國都尉。蜀郡屬國在蜀郡西南部。
冀州刺史王芬等謀假以出兵剿黑山軍，趁帝訪河間郡舊宅時劫帝，誅宦官，廢帝，立合肥侯為帝。
正巧北方夜半有赤氣，東西竟天，太史令王立上言北方有陰謀，不宜北行。帝乃止。
帝敕令王芬罷兵，接著又征王芬入朝。王芬懼怕，掛印逃走，至青州平原郡，自殺。
遼東襄平人尚書郎公孫度出任冀州刺史，但因謠言，旋即被罷免。東郡聊城人議郎賈琮繼任冀州刺史。
賈琮在任議郎前出任過豫州刺史，京兆尹、交州刺史。
青州平原郡、冀州甘陵國清河國、兗州東郡、司隸河南尹、司隸河內郡、司隸弘農郡、司隸河東郡等黃河沿岸七個郡國發大水，朝廷、郡縣官吏寡救，民不聊生。
秋七月，射聲校尉司隸右扶風郡茂陵縣人馬日磾為太尉。馬日磾乃經學大師馬融之族人。袁術叔伯袁隗之妻馬倫為名儒馬融次女。
八月，皇帝見天下大亂，動用私人金庫組建皇家西園軍，設西園八校尉，每人設二千兵編制，招滿可達一萬六千人。
以宦官小黃門司隸河南尹洛陽人蹇碩為上軍校尉
虎賁中郎將豫州汝南郡汝陽縣人袁紹為中軍校尉
屯騎校尉兗州泰山郡平陽縣人鮑鴻為下軍校尉
議郎豫州沛國譙縣人曹操為典軍校尉