孫恩之亂既平，徐道覆之謀又被挫敗，三吳之地暫時脫離了刀兵。
天師道經此一亂，為孫恩所累，損失龐大，十數萬信眾一朝喪盡，想要恢復談何容易況且天師道的名聲早已是今非昔比，與那過街老鼠無甚差異，若非天師杜子恭及時表態，與孫恩一刀兩斷，極力挽回，只恐今日之天師道已不復存在
不過，杜子恭好歹也做成了一件好事，他派人聯系姚盛棄暗投明算是成功了，為徐宗文徹底平定孫恩之亂也算是盡了三分綿薄之力，看在這一點上徐宗文也不會趁勢對天師道有什么動作。
錢唐收復后，徐宗文向朝廷舉薦了三吳之地缺額的官員，沒過兩日徐宗文又親自趕到吳縣，他去為殉國的晉軍將軍選擇義冢的地址去了。
此次孫恩之亂不算三吳郡兵，光是徐宗文先后派遣的狼衛營、朱雀營就傷亡了六千多人，陣亡者達到前所未有的的四千之數，這是當初北伐時都不曾有過的大傷亡，讓徐宗文心中惋惜不已
究其原因，驍騎軍之所以付出如此大的代價要歸咎于南方地勢，驍騎軍中大半數都是北方人，是徐宗文北伐時收復故土之地的漢家遺民，驟然來到江左，免不了有些水土不服，戰力大損，所以造成這么大的損失。
除了向朝廷要錢糧修義冢，徐宗文并沒有讓驍騎軍返回洛陽的打算，他將朱雀營全數留在會稽山陰，由司馬劉裕節制，算是熟悉江左水土，撿個教訓。
劉裕手下如今只剩下不到五百的裁撤禁軍，這些當初被徐宗文毫不留情裁撤的禁軍到也有些血性。先是跟隨徐宗文南下錢唐救災，如今又在平亂之中出力不少，剩下的這些人他打算帶回建康，交由禁軍大統領張松之，畢竟是上過戰場的兵，總規是不一樣的，至于編制，歸屬別部司馬統領即可。
處置好一切軍政民務之后，徐宗文走晉陵運河入京口回了建康城。
聽聞征北大將軍剿滅為禍三吳的大魔頭孫恩得勝歸來，京城軍民無不歡欣鼓舞，輿情鼎沸
徐宗文換了馬入城時，百姓們擁堵著來到秦淮河邊迎接，朱雀門內外早已張燈結彩，人山人海。
尚書令王珣、中書監王恭和尚書左仆射王國寶、尚書右仆射張玄之四人引領在京的文武百官早已恭賀再次多事。
徐宗文的大隊人馬甫一入境，樂府凱歌緩緩響起，龐博大氣的鐘鼓之聲響徹秦淮兩岸，引得軍民震動，歡呼喝彩
“大將軍威武”
“大將軍戰無不勝”
“大將軍萬勝，大將軍威武”
兩岸歡聲雷動，望著無邊無際的人海，徐宗文一邊喊著晉軍威武，陛下萬歲，一邊在人群中努力尋找那一個心心念念，魂牽夢縈的倩影，奈何終不得
建康晉軍除了被王忱禍害的右神武軍，其余的各營留守都來了人列隊迎接徐宗文，龐大的軍民隊伍一直從朱雀門延伸到廣陽、宣陽兩座南大門，朱雀大街上到處都是萬歲威武之聲，此等盛況怕是連當初開國時都不曾有的
“諸位請快快回城，怎么能勞動諸位大駕來迎接我徐驍一人呢實在是受之有愧，受之有愧啊”徐宗文下馬拉著尚書令王珣與中書監王恭二人，三人一副和諧相處的景象，一時間聚集了百官和所有軍民的視線。