在陸繹的整頓下，宮禁確實比之前嚴格多了，所以雖然有給事中彈劾陸繹挾私報復，但是朱載坖并沒有多在意。
而從南京發來的一份奏疏還是引起了朱載坖的注意，這是督師南京大學士張居正和南直隸巡撫楊繼盛聯名發來的奏疏，主要是向朱載坖匯報在蘇松實行考選小吏的情況。
在張居正、楊繼盛的主持下，蘇松兩地的府縣衙門從秀才中考選小吏，試行一年之后，張居正、楊繼盛認為這些考選的小吏足夠勝任衙門中的各種事務，請求朱載坖推廣這種制度。
當然，張居正和楊繼盛也提出這種制度的不足之處，其一是現在大明的小吏是不允許參加科舉的，這使得參加吏員考選的秀才多是久試不第的秀才，年齡都偏大，不利于州縣衙門的運作，針對這個情況，張居正和楊繼盛建議，效法宋代的鎖院試制度，允許這些有功名的吏員繼續參加科舉。
其二就是現在吏員的上升渠道實在是非常有限，吏員幾乎是無法等到晉升，甚至遷轉為官，在這種情況下，吏員很容易就會腐敗，謀取錢財，所以張居正等人認為，應當遵循唐宋之意，允許吏員積勞成考，考滿入流，由吏員升遷為官，打通吏員的晉升渠道。
對于他們兩人的奏疏，朱載坖沒有第一時間御批，而是先下內閣，令內閣諸位閣老商量之后，報朱載坖，然后再作決斷。
對于張居正和楊繼盛的奏疏，內閣的分歧是相當之大的，李春芳、陳以勤是堅決反對的，他們認為雖然朝廷講求三途并進，但是吏員升遷為官，應當是特例而非制度，如果吏員們經過考課，可以順利升遷為官的話，那舉人、進士們皓首窮經，豈不是成了一個笑話。
在李春芳他們的眼中，吏員始終是卑賤的行業，李春芳說道：“宋史曾言，吏人皆士大夫子弟不能自立者，忍恥為之。”
言下之意就是吏員出身卑賤，當他們升遷為官，有失朝廷體統。
而高拱、郭樸則認為吏員循例升遷，符合三途并進之策，而且根據唐宋的規矩，吏員要想遷轉為官，需要嚴格的考核和漫長的時間，以唐代為例，吏員正常是八考入流，甚至有些時候是十考入流。
也就是說，最少需要八年，吏員才能升遷為官，而且時間并不是唯一的要求，按照唐代的規定，八考六上，才能升遷為官，從流外升入流內，也就是說在八年的考績中要有六年達到上等才能升遷，同時在這八年之中，不能有下等考績，只要有就不能升遷，僅僅勞數夠，勞績不足，還是不能入流。
而且即便是升遷，擔任的官職也是很低的，唐代吏員入流敘官為本司主事及上縣尉，大明應該也是如此，吏員升遷也就是九品或者八品，基本上就是擔任巡檢、主簿等州縣的佐貳官，而進士出身就是七品，這是吏員出身遠遠不能及的，所以高拱等人認為張居正的辦法可以施行。
高拱和李春芳互不相讓，內閣不能達成一致，也只能將內閣的意見如實陳述，于是朱載坖將張居正的奏疏下部議，交吏部商議此事。