對于朱載坖的這個看法，張居正不置可否，張居正擔心的是整個官僚集團對于朱載坖一系列措施的反制，因為朱載坖一面降低進士入仕之后的官品，一面又開明法、明算兩科，對于很多官員們來說，他們會擔心進士出身以后不再是大明官員的正途了。
這點朱載坖認為大可不必擔心，確實用數量來看，以后進士出身的官員在數量上也許不占大明文官的絕對優勢，但是進士絕對是大明高官的唯一來源，進士們雖然現在入仕的官品被降低了，但是從其他方面來說，進士出身的官員們在很多方面都是極大的優勢的，首先進士出身的官員僅僅需要擔任一任佐貳官，只要考成中等以上，就可以直接轉任正印官，這是其他所有出身都不能比擬的。
除此之外，進士出身還有兩個其他出身的官員都無法獲得捷徑，只要一任正印官考滿，考績中等以上，在任內沒有重大過失，沒有被御史彈劾貪墨、枉法等事項尚未查清的，都可以參加御史的考選，這是其他出身的官員多沒有的待遇，舉人出身和吏員出身的官員雖然也可以參加御史的考選，但是難度遠遠比進士出身的官員們大。
按照朝廷的規定，科道御史年齡必須在四十五以下，必須要同時有佐貳官和正印官的考滿資歷，同時對考績也有要求，同時履歷中不能有重大過失、貪墨、枉法等被御史彈劾尚未查清的問題。
光是年齡一項，就已經卡死了絕大部分吏員或者舉人出身官員考選御史的路了，因為他們大部分因為長期的考試或者宦海生涯，往往年齡都比較大了，而且在地方任職的時間越久，就越容易出現各種問題，這點限制了他們考選御史，而且朝廷還規定吏員、舉人出身的官員考選御史，需要經過上級正印官和巡按御史的考語，若是正印官和巡按御史不同意的話，這些官員們就無法考選御史。
如果說御史的考選對于吏員和舉人出身的官員已經是非常嚴苛的話，那么翰林院的考選則是根本與吏員、舉人出身的官員沒有任何關系，對于翰林院的考選，第一條要求就是進士出身，其他各種出身的官員一概沒有資格參加考選，翰林院只招收進士出身的官員。
而在大明，眾所周知的升官快車道就是兩條，一就是科道，科道御史雖然品級不高，但是權力極重，而且考滿之后，連升三級外放，一般都是布政司參議、按察僉事起步，要是能夠一直在都察院升任到僉都御史一級，那就進入了高級言官的隊伍了，而在大明，出任巡撫的最低職務要求就是僉都御史，只要能夠混到僉都御史，外放巡撫就指日可待了。
而對于大明官員們來說，升官最快的就是翰林院了，只要能夠進入翰林院，那就是儲相之尊，能夠進入翰林院那就是進入了升官的高速公路了，尤其是現在，翰林院的權勢更重，不僅僅是朝廷的儲才之地，更是還要兼任六科給事中，是皇帝的耳目，其不僅處于權力中心，而且能夠直接掌握權力。
在翰林院學習之后，外放就是知府和六部郎中級，如果能夠混到學士，不管是侍讀、侍講學士，侍郎的帽子就基本上穩當了，所以對于大明官員們來說，翰林院才是最為厲害的地方，只要能夠進入翰林院，那三品就是起步價，但是翰林院考選的首要標準就是進士出身。
所以朱載坖認為，現在進士出身的官員可能在數量上不占太大的優勢，但是在中高級官員大的比例上，進士出身官員肯定是占據絕對優勢的，不管是都御史、尚書侍郎、各寺正卿、少卿，乃至于地方督撫、布按二司一直到到各道、知府等官員，進士出身的官員絕對是占據優勢地位的，這點是毋庸置疑的的。
所以朱載坖認為朝廷對于進士科實際上還是極為優待的，這些進士出身的官員不僅僅在升遷上具備很大的優勢，在職務的選擇上肯定是有占有極大的優勢的，吏部在分派官員的時候，沖、難、繁、險的地方肯定是要優先分派經驗豐富的官員，往往就是吏員、舉人出身的官員去，而進士們任職的，一向就是相對比較安定，不那么難治的地方，以保證他們考績不至于太難看。
對于朱載坖所提出來的這些問題，張居正也予以承認，張居正提出了一個問題，朝廷開明法、明算兩科，取士多少呢？
這確實是個很嚴肅的問題，現在朝廷主要的取士選官方式是三條，第一自然是科甲出身，三年一科，一科不過四百進士，然后就是舉人出身的官員，凡舉人會試不中者，可以直接銓選府州縣學教職和州縣佐貳官，舉人選官也是有一定的要求的，一般是到吏部注冊候選，候選三年以上、文學可觀、年力精壯的舉人內揀選官員。
按照吏部題定，凡舉人揀選，須經過六道流程。第一步，張貼告示，示限入揀年份。
第二步，舉人自行呈明，文選司核驗資格。會試后，符合資格之舉人、歲貢生，“各具通狀，于三月初旬”赴文選司投遞，文選司查對選簿年月相同，先期具本題請。
第三步，文選司揀選，擬取雙倍人數。文選司核明后，確定“大約擬選人數，舉人二分，歲貢一分”，先行“倍取”。
第四步，堂官揀選，公布名單。吏部堂官于文選司所揀舉人內再行揀選，“俱年貌器度相應”，“當日列名示知”。
第五步，赴堂考試。揀定之舉人隨后在吏部大堂考試，文選司“納卷彌封”，排定名次。
第六步，吏部名單上奏內閣，由內閣和都察院再次復查，復查無誤之后，由都御史和吏部尚書一道上奏朱載坖，經過朱載坖御批之后生效，文選司發給官憑。</p>