朱載坖明白徐階的意思了之后，當日就下旨，起復原南京右僉都御史吳時來為大理寺卿兼提督律例館，負責大明律例集結的編撰工作，朱載坖以特旨起復吳時來的舉動使得朝廷里面很多都有些詫異，吳時來是徐階的心腹，這點是官場上幾乎人盡皆知的事情。
在徐階下野多年的時候，吳時來被朱載坖特旨起復，這事情就有些奇怪了，前腳張居正剛剛攆走自己的同科，徐階的好學生陸光祖，結果后腳朱載坖就特旨起復徐階的死黨吳時來，這就很有意思的，徐閣老雖然不在朝堂，但是朝廷仍然有徐閣老的傳說。
其實朝廷里面的明眼人都已經看出來了，這是徐階對張居正的反制，同時也是對申時行的支持，吳時來雖然是徐階的心腹，但是很顯然，他再度回到朝廷，所能夠依靠的就只有申時行了，作為徐階的鄉黨兼姻親，申時行現在已經成為了東南出身的官員們的領頭羊，這點也正是徐階所要表達的意思。
這樣一來，就會平衡張居正和申時行之間的力量，之前張居正的力量過于強大，而現在原本在張居正陣營中的徐黨、東南出身的官員將會從張居正的脫離出來，申時行的力量將會得到增強，這也正是朱載坖所希望看到的，朱載坖不希望有強臣的出現，這點是朱載坖一貫的策略，雖然朱載坖現在需要張居正推動新政，但是對于張居正的實力過于膨脹，也是要予以警惕的。
在朱載坖特旨起復吳時來之后，申時行立即向朱載坖上疏，請求速決內閣輔臣的名單，朱載坖命令在京四品以上都可以上疏舉薦人選，看看朝廷之上對于內閣輔臣的人選有什么看法，而張居正是很沉得住氣的，不僅張居正沒有上疏，連張居正的政治盟友或者小弟們也都沒有上疏參與此事。
而朱載坖命令司禮監文書房將這些奏疏都整理出來，看看臣子們都舉薦了些什么人出來，其實臣子們所舉薦的人宣布，大部分并沒有超越朱載坖的所預料，臣工們所舉薦的人選主要是陳經邦、沈鯉、王錫爵、沈一貫等人，朱載坖這些人選，朱載坖并沒有太大的意外。
朱載坖在看了這些人的奏疏之后，決定召見內閣輔臣，商量入閣的人選，朱載坖說道：“在京官員們所舉薦的陳經邦、沈鯉、王錫爵等人，卿等以為誰可以入閣？”
面對朱載坖的這個問題，內閣輔臣們顯然是所準備的，申時行很清楚，朱載坖將王錫爵剛剛提拔到了吏部左侍郎的位置上，不可能馬上就讓王錫爵入閣的，所以這次入閣肯定是沒有王錫爵什么事情，這點申時行是很清楚的，當然這種事情首先是要張居正這個首輔發言的。
張居正認為，這次入閣的輔臣主要是出鎮南京，督師南京，鎮守東南的，所以要考慮任命一位有地方經驗的閣臣，同時還要考慮回避的問題，朱載坖當然是很清楚張居正的意思，張居正就是不想內閣再增加一位東南出身的輔臣了，對于張居正而言，還是要盡可能的選擇一個非東南出身的輔臣入閣。
經過張居正的這么排除，王錫爵是肯定不行了，雖然他有地方官經驗，但是王錫爵是蘇州府太倉人，顯然不符合這個條件，而沈一貫也是浙江人，自然也被排除，陳經邦雖然是福建莆田人，籍貫上符合條件，但是陳經邦從中進士以來，主要是在翰林院和禮部工作，沒有地方州縣經歷，自然予以排除，雖然張居正沒有明說，但是實際上張居正的意思是很明顯，舉薦沈鯉入閣。
沈鯉是河南歸德府虞城人，嘉靖四十四年進士，沈鯉的為人特點就是極為謹慎，入仕以來斷絕私人的交往，喜好推舉賢士，不使人知曉。沈鯉起初做翰林官時，司禮監黃錦因為是他同鄉送禮給他，他拒不接收。教導于內書堂，侍講經筵，都多次與大宦官接觸，未曾同他們交往。
沈鯉是高拱所看中的人，高拱在遺表當中向朱載坖舉薦沈鯉，認為他經術閎深，議論正大，真一代偉人。希望朱載坖能夠提拔于他，沈鯉雖然和張居正沒有往來，但是對于新政，受高拱的影響，沈鯉也是贊同，這也是張居正舉薦于他的原因，張居正認為沈鯉出鎮南京，一定能夠幫助朝廷繼續深入的推行新政。
朱載坖于是問道：“諸位以為沈鯉如何？”
對于沈鯉，申時行也有過接觸，和沈鯉的關系也還不錯，申時行也同意沈鯉入閣，朱載坖于是當即下詔，禮部右侍郎沈鯉加東閣大學士，督師南京節制東南水陸軍務事兼督理糧餉，同時朱載坖認為內閣還應該增加一名閣臣。
現在內閣除了沈鯉之外，就只有張居正、潘晟、申時行、余有丁四人，很明顯張居正、潘晟一派，申時行、余有丁一派，朱載坖認為對立過于明顯了，還是要予以調和的，要向內閣中增加新鮮血液，朱載坖向他們詢問羅萬化如何。
羅萬化是隆慶二年的狀元，學問是沒的說的，當初朱載坖之所以取中他，就是因為羅萬化的策論中明確提出：“君天下者，興化致理，政固多端。然務本重農，治兵修備，乃其大者。”
羅萬化的政治主張是很明確的，他一直主張履畝而正界，也就是對大明的土地進行清丈，抑制這些豪強的土地兼并，而對于軍務，羅萬化的主張是“重將帥”、“先決戰”、“先理財”，而且羅萬化是大明現在唯一出使過歐洲的部堂級大員，也是朱載坖的第一位狀元，真的的天子門生，所以朱載坖對于羅萬化是很重視。
見朱載坖提議羅萬化入閣，張居正立即予以贊成，申時行也沒有表達異議，朱載坖隨即下旨升羅萬化為禮部尚書、東閣大學士，入閣預機務，仍掌理藩院事。</p>