當然，對于大明在倭國的主要任務，自然是獲取倭國的金銀和銅料等，徐渭對此也有了自己的看法，徐渭認為，倭國的金銀礦和銅礦很多，大明不可能全部都予以控制，當然，向石見銀山等大的金銀礦要朝廷直接予以控制，但是對于一些中小金銀礦和銅礦，朝廷可以與倭國地方豪強、倭國朝廷一道予以開發，大明提供技術等，幫助倭國開發金銀礦，同時用一些他們所必須的物資予以交換，使得朝廷能夠獲取大量的金銀和銅料。
對于大明來說，軍事手段當然是很重要的，但是經濟和其他手段也很重要，大明要在倭國推行儒學教育，用大明的佛法感化這些倭人，奉大明正朔，用大明貨幣，讀大明詩書，這樣加以時日倭國才能夠和大明同心同德，不再成為大明之患。
同時為了防止倭國再度成為大明之患，朝廷還要采取各種措施對倭國予以限制，主要是在金屬冶煉、船只制造、火藥等方面的各種技術和書籍都堅決不能流入倭國，不能讓倭國再次成為大明的禍患。
徐渭在處置倭國善后事務疏中向朱載坖建議，在倭國下達兩道命令，第一是廢刀令，就是廢黜武士階層的特權，消滅所謂武士階層，因為倭國除了朝廷之外，還有各藩的藩主，這些藩主都是地方的豪強，各藩藩士、其中主要是武士，他們的工作就是為藩主打仗賣命。這些武士與藩主是家臣與主君的關系。家臣為主君工作，主君要給家臣俸祿，他們之間是一種從屬關系。
這些武士往往就是禍亂的根源，他們享有各種特殊待遇，其中最重要的就是佩刀，刀是這些武士身份的象征，徐渭認為，這些人以武犯禁，決不能容忍，廢黜他們的種種特權，倭國朝廷和各地方藩主按照人口和封地的多少，在大明的批準之后可以擁有一支僅限于維持治安的軍隊，不準擁有火炮、火銃、戰船等重裝備，有叛亂等事情，上奏倭國朝廷請求大明安東都護府予以鎮壓即可。
凡是不是倭國朝廷和各藩的軍隊人員，不管什么身份，都不允許私藏武器，違者斬立決。
除了廢刀令之外，就是刀狩令，收繳倭國農民持有的刀劍、長槍、火器等武器，將流散在倭國民間的武器予以收繳，大明以農具、金銀、糧食、布匹等作為獎勵，收繳倭國國內的武器，嚴禁民間持有刀、脅差、長槍、火繩槍等作戰武器，實施過程中采取分級收繳制度，由村落頭人負責統計上報，大名派遣檢使監督執行，最后由倭國朝廷和大明安東都護府對整個倭國的收繳武器情況進行檢查。
同時廢刀令和刀狩令，消弭倭國可能作亂的物質基礎，同時在輔以用儒學、佛教加以教化，對于倭國實現無害化處理，為了使得倭國百姓支持大明，在削平了倭國的這些豪強之后，由大明安東都護府規定倭國賦稅的上限，降低農民的負擔，將倭國境內的浪人等予以雇傭整編之后調往其他地方如安南等地，逐步加以消滅，將倭國的反抗消弭，使得朝廷的利益能夠最大化。
徐渭的奏疏到了朱載坖的案頭之后，朱載坖沒有立即對于徐渭的倭國善后疏進行討論，而主要是對于徐渭所要求的增兵問題進行討論，徐渭要再向倭國增兵五萬，同時日后還在安東都護府增加五衛兵力，才能夠保證倭國安寧。
對于增兵問題，群臣現在還是同意增兵的，但是對于兩個問題存在爭議，首先是增兵多少的問題，徐渭要求增兵五萬，但是群臣認為增兵多少主要由兩個方面的原因決定，第一是倭國現在的戰局需要多少兵力，第二就是朝廷的后勤能否維持官軍的作戰。
現在大明為了維持在倭國的征發，已經動員了整個北洋水師和大量的民間船只，再增加兵力的話，后勤壓力更重，所以有部分臣子們認為要謹慎增兵，但是朱載坖認為，現在安東都護府在佐渡島上的屯田，還有倭國的繳獲、購買的糧食能夠極大的緩解安東都護的后勤壓力，而且現在正是削平整個倭國豪強的大好機會，決不能放過，要立即滿足徐渭的要求，抽調官軍前往倭國。
而另外一個問題就是抽調哪里的官軍，之前的五萬官軍，是朱載坖從京營抽調的，這次如果再從京營抽調的話，就從京營抽調了十萬官軍了，雖然現在京營兵力雄厚，但是也經不起這么折騰，很多臣子們都建議從其他地方抽調官軍，這點朱載坖倒是接受了他們的建議。
京營當然要外出征戰以鍛煉戰斗力，但是地方官軍也要經常上戰場磨練才行，但是這次是跨海作戰，還是要主要以沿海省份為主，朱載坖和參贊軍務大臣和閣部重臣們商量了之后，決定主要從遼東、山東、南直隸三省調發官軍增援安東都護府，主要因為這三省都靠海，而且氣候和倭國有相似之處。
朱載坖和重臣們商量之后認為，遼東官軍在倭國頗為威名，但是遼東要承擔防備女真和土蠻部的重任，不能過分削弱，只從遼東抽調一萬官軍，然后從山東和南直隸抽調兩萬官軍，一共五萬官軍，到天津集結之后，渡海前往倭國，增援安東都護府。
沒有想到朝廷征伐倭國的消息傳開之后，浙江巡撫沈煉上疏，稱浙江久被倭寇荼毒，聽聞朝廷征討倭國，兩浙軍民振奮，乞朝廷調兩浙之兵征討倭國，以報當日之仇。朱載坖略一思考之后，認為確實是應該讓浙兵參戰，命令從南直員額中減少五千，調浙江鎮官軍一萬，一共五萬五千人馳援安東都護府。
對于徐渭的倭國善后疏，朱載坖沒有明發討論，而是直接御批同意，命令徐渭相機實施即可，不必奏報。</p>