對于鄭成功變革編制，鄭家軍的舊部反應比較激烈，原因在于鄭成功將第3軍鎮、第4軍鎮讓給了“外人”。
不過鄭成功收復廣州府、肇慶府的威望讓鄭家軍舊部還是默認了編制的變更。
“讓李元胤擔任第3軍鎮的將軍，大為不妥。他是李成棟的義子，若是他臨陣叛變，我們說不定會輸掉與清軍的決一死戰。”
鄭鴻逵作為鄭成功叔父輩的元老，他還是向鄭成功提醒。
“李元胤在廣州府的時候打開城門接應我等入城，李成棟與之對他恨之入骨，是不可能再接納他，他只有死心塌地跟著我們才能在亂世活下來。另外，他的第3軍鎮有一個營是廣州府的兵源，不會愿意跟他反叛。”
鄭成功已經做好了準備。即使李元胤背叛，他只能帶走半個軍鎮，不足為懼。
“看來你考慮的很周全了，以后我不再干涉。”
鄭鴻逵見鄭成功逐漸成長起來，知道鄭家軍不能有兩個話語中心，于是主動向鄭成功示意放權。
鄭成功領會到鄭鴻逵的意思，當然他要從鄭鴻逵那里得到更多的話語權，也不能完全真的奪走鄭鴻逵的權力，鄭鴻逵才三旬，正值壯年：“請叔父擔任第二軍鎮的將軍，我們一同伐清。”
鄭鴻逵感慨：“半年前我們逃亡至廈門島時，我已經對伐清不抱希望，只想著不降清兵，與當年你父親一樣在東南沿海當海盜即可。但是現在半個廣東布政司為我們所有，伐清不是一句空談。”
“請叔父放心，以后我會逐步為各個軍鎮配置火槍、火炮，以及實行一些配套的制度。”
“什么制度？”
“一套完整的軍事參謀、后勤、監察制度。”
鄭成功說出他的野心。
軍鎮制度很容易形成軍閥，鄭成功打算通過參謀、監察、后勤等方式削弱一個將軍對軍鎮的影響力。
鄭鴻逵有些吃驚，他這個侄子竟然想到這些內容，還真是不簡單。
“我們鄭家軍現在還不至于尾大不掉，正是建立新編制的時候。要是以后壯大，變革的阻力就會無比龐大。”
鄭成功當然知道一個龐大的勢力想要打破重建，何等困難。鄭家軍只有2萬人，占據半個廣東布政司，正是建立參謀部、監察委員會、后勤部的好時候。
框架搭建好了以后，以后部眾更多，也可以融入框架。
他要建立一套完整的近代軍隊制度。
鄭成功與鄭鴻逵正在商議以后鄭家軍的走向，一個親兵過來在鄭成功耳邊附言。
鄭成功聽后微微一驚。
鄭鴻逵問道：“發生什么事情了？”
鄭成功沉默了一下才答道：“鄭彩擊殺了魯王任命的大學士熊汝霖，還軟禁張煌言，吞并了他的部眾。魯王朱以海派人前來向我們求援。”