隨著時間的推移，凌云翼率軍進入九州薩摩地這一“黑天鵝”事件，在日本引發了劇烈的動蕩。
萬歷十二年八月十日，二條昭良收到的平戶城急報，當時差點尿了褲子。正親町天皇看了松浦鎮信的來信后，也愣了半天。后來在二條昭良建議下，天皇將正在京都各處打秋風、賣扇子的公卿們召集起來，討論如何應對傳旨欽差。
公家大臣們先是大罵明虜，后來又因為毫無辦法而大哭，正親町天皇身體本來就不好，被他們吵得頭疼，就宣布散會。
太政大臣二條昭良到天皇御所求見，正親町天皇表示自己本來就不想干這倒霉差事——要不把大位傳給現在最強武家羽柴秀吉得了，也省得后世子孫糟心遭罪。
二條昭良受此啟發，出主意道：“要不陛下您發諭旨，將天下武家匯聚京都，讓他們跟明軍交涉。若扛得住，誰立功最大，朝廷就授予其關白之位；若扛不住，咱就躺倒挨錘。”
正親町眼前一亮，覺得這辦法好。隨即又怕武家不給面子，到時候沒人來可成笑話了。二條昭良回奏道：“別人不敢說，羽柴秀吉肯定愿意張羅這事兒，他個泥腿子有進位關白之機，這家伙不可能拒絕！”
“而只要有一個武家來到京都——其他有志于上洛的武家就不可能不來，光明寺之會必然成功！”
不出二條昭良所料，諭旨發出之后，羽柴秀吉第一個響應，從近江與柴田家對峙的前線返回京都。隨即支持織田信孝的柴田勝家也奉旨回京。
德川家康盡管與織田信雄貌合神離，但也不能讓秀吉占了先手，于是也返回京都——光明寺之會上，如今的天下大藩除了北條家督北條氏政之外，其余的大大小小武家來了一大半還多。
原時空的本能寺之變后，織田勢力因為三法師的存在，雖然分裂，但開始的時候是分裂成兩塊——柴田勝家與織田信孝一方，對羽柴秀和三法師一方，德川近乎中立并偏向三法師。
一直到羽柴秀吉擊滅了柴田勝家，織田信雄和德川家康才下定決心跟羽柴秀吉翻臉。后來在小牧長久手之戰后，羽柴秀吉利用外交手段，讓織田信雄和德川家康分裂，很快就完全統合了織田信長留下的地盤和勢力。
在本時空，因為朱翊鈞的亂入，導致羽柴秀吉統一戰國的步伐大大減慢。先是在討伐明智光秀的戰役中，有人向柴田勝家通風報信，柴田勝家得以脫離與上杉家的戰斗及時返回，在政治上沒有丟分。
其次因為三法師和前田玄以被殺，在決定織田家命運的清州會議上，原時空站在三法師一邊的織田信雄認為秀則之母已經葬身火海，襁褓幼兒無法保障織田家的利益，因此也挑旗立棍，與織田信孝爭奪繼承權。
而德川家康也一改曖昧態度，旗幟鮮明的支持織田信雄，致使織田家分裂成三塊——羽柴、池田、丹羽長秀支持的秀則勢力最強，織田信長次子信雄和德川家居次，柴田勝家和織田信孝最弱。
兩家變三家就會出現三體問題，再加上黑田孝高的遇刺，導致羽柴秀吉在好長一段時間內進退失據，一直到現在也沒有擊滅柴田勝家。而在原時空，羽柴秀吉此時已經快結束亂世，建起大阪城了。