朱佑樘也沉默了，他雖然知道情況不太好，他也在努力的改變這種情況，而且是嘔心瀝血，可是沒想到情況居然糟糕到了這樣的地步。看了一眼兒子，朱佑樘又覺得很欣慰，自己這是后繼有人了，想了想，朱佑樘開口問道：“那你想到什么辦法了嗎？”
“這天下終究是士人治理的，大明雖然不是與士大夫共天下，可是時至今日也差不多少了。”
“咱們父子二人終究是在這紫禁城里面，能懲處多少人，又能殺了多少人呢？想做又能做多少？既然你看到了，你覺得不公，那你覺得該怎么辦呢？”
朱厚照看了一眼朱佑樘，父子二人都沒提牟斌，可是父子二人都知道，朱厚照已經在為牟斌求情了，而朱佑樘也聽進去了。朱厚照剛剛說那些話，朱佑樘也聽進去了，朱佑樘現在問的就是如何一勞永逸的解決這個問題，這才是為君之道。
朱厚照知道，前面自己說了那么多，如果拿不出來一個全局性的辦法，老爹會失望的，自己謀一域之后，到了謀全局的時候，這才是帝王該有的胸襟。
至于葉家的事情，或者說葉淇的死，朱佑樘并未看在眼里面，別說一個退了的戶部尚書，在職的戶部尚書又何如？皇帝想收拾一樣收拾，朱佑樘想看到的是兒子的辦法，不是發泄，不是對整件事情抱怨，而是如何解決眼前的事情，無論王道還是霸道，行得通就是好道。
“兒臣覺得首在吏治，完善監察制度和整飭吏治刻不容緩，裁汰老弱昏官，嚴懲貪腐，懶政怠政一律嚴懲不貸。”朱厚照看著朱佑樘說道。
“朝廷有都察院，各道有監察御史，六部有清吏司，內廷還派了守備太監，可是吏治還不是這樣？”朱佑樘搖著頭看向兒子，開口問道：“吏治自古以來都是大問題，每一個帝王都想要解決吏治，都想要吏治清明，可是又有多少人能做到？“
朱厚照搖了搖頭，然后開口說道：“父皇，朝廷雖然有很多的監察衙門，可是官官相護啊！再說了，這些人如果也貪污了，那怎么辦？就像這一次的揚州一樣，各地的守備太監，不是兒臣看不起他們，他們不是那些文官的對手，還是要另想辦法。”
聽到兒子這么說，朱佑樘也來了興趣，笑著問道：”那你有什么辦法？說來聽聽。“
“官員最了解官員，官員也最清楚官員，兒臣想推出秘本制！“朱厚照沒有絲毫的猶豫，直接將自己的想法說了出來，事實上秘本制就是清代的密折制，這個制度在清代發展到了巔峰，甚至連立皇儲都是密詔立儲制度，將冊立皇儲的密詔藏于乾清宮正大光明的匾額后面。
清朝入關之初，沿襲大明舊制，官員有事報告皇帝，公事用題本，私事用奏本。
題本蓋印，奏本不蓋印。題奏本都由通政使司進呈，在皇帝閱批之前，內閣大學士已經“票擬”過。因此，這兩種文書都是公開的，不利于下情上達。其次，題本辦文程序太繁，運轉速度十分遲緩，而且由于經辦人員過多，容易造成泄密，使皇帝實施政務受到很大限制。