再有，因為此事涉及到尚書省、御史臺和吏部、戶部，因而交給三司審理都會有徇私之嫌。二人的意見以為還是御審為上，也就是由趙昺主理此事，由刑部和大理寺協助。而人犯仍由御前護軍看管，這樣便隔斷了他們與外界的聯系，避免了相互串通。同時審理工作采用密審，而非過去的公開審理，卻可在審出同謀后公開進行抓捕，以起到震懾作用。
趙昺想想如此安排較為妥當，這樣一來自己就可以準確的判讀出此次事件的性質，同時他也有了較大的裁量權，可以控制此次事件的涉及的廣度和深度。從而可以從容不迫的做出安排，避免因此影響到朝廷的正常運轉，又能讓群臣感到來自皇權的壓力。
另外，趙昺大婚和親政的日子近在眼前，不宜因為此事大肆殺戮，畢竟這無論是在古代人和現代人看來都是不吉之事，所以在處置時應采用嚴進寬出的策略。即要在嚴審的基礎上獲得確鑿證據，才抓捕涉事之人，而對于在其中作用微弱者只訊問，不抓捕；在處理上同樣如此，首犯從嚴，脅從從輕，不株連無辜。以達到打擊少數，挽救大多數，教育一大片為目的
下午的朝會上，眾臣發現護軍皆已退出大殿，宮禁業已解除，不由的都松了口氣，但是大家再一次感受到了小皇帝對軍隊的掌控力。他們知道只要軍隊仍然忠于其，小皇帝就有能力鎮壓一切反抗其的能力，同時讓眾人感受到無形的壓力，若是將陛下逼到絕境，他必會打破朝中的平衡，建立其武將主政的政權，那么他們的生存環境將更為惡劣。
而接下來，小皇帝并沒有深究早朝之事，只是稟明太后為保證查清事實，他要親審此案，太后準奏。這又讓些人緊張起來，誰都知道此事是針對小皇帝的，其中的意思只要不傻都明白是要達到什么目的。現下太后準許小皇帝親審此案，那還不是想整誰就整誰，其只要歪歪嘴就不知道誰會倒霉，剛落下的心就又提溜起來了。
趙昺此刻倒是氣頭兒過了，就當找了個事情做來消磨親政前最后一段時光。雖說是他主審，但他有自知之明，自己不是那塊料，倪亮那幫當兵的也不行，還得調專家。于是乎案子實際上就落到了事務局身上，由鄭虎臣專門組織了一個審訊班子負責這件謀逆大案。
對于事務局的辦案能力，趙昺還是有信心的，他們不僅辦案經驗豐富，且收集證據的手段和能力在大宋無人能及。至于能不能問出結果，他是從不懷疑的，骨頭再硬的漢子落到他們手里不開口都難。況且是那些弱不禁風的文人們，只怕能熬過兩輪的都可稱為英雄了。
不過在這個年代還未有保護人權，不得實施肉刑逼宮的規定，反而是不打不招的思想大行其道，審訊之事先不問話而是先來頓板子再說。所以在宮中用刑，打得鬼哭狼嚎的實在有失體統，于是便將辦案地點設在了御前護軍都統府，隱蔽又安全，都是自己的地盤隨便折騰。
至于擔任協助的刑部和大理寺，鄧文原和龔行卿兩人也都是懂事兒的，除了第一天兩人親至點了個卯以后便不露面了，只各派了個郎中來陪審。但是他們基本就是陪著，從不多話，只是每日審訊結束后在筆錄上例行署上自己的名字，刷個存在感而已。他們這種恭順的態度，讓趙昺十分滿意，不僅能夠擺正自己的位置，還懂得自己的心思