指揮官沒有急于下令趕往下一處目標，因為他注意到這處海灣里根本就沒見著有船活動，而對手的戰船如果還在海灣內，這個時段理應會出現在造船廠附近的海面上，用艦載火力與攻擊造船廠的明軍展開戰斗才對。所以他有理由懷疑，在聯軍艦隊殺到福江島之前，情報中提到的停靠在海灣內的戰船就已經轉移去了別的地方。
要驗證這個結論，其實不需行軍十幾里才能看到港口的情況，只要派人拿著望遠鏡去到臨近的山頭高處就能查看目的地的狀況了。
于是一支小分隊立刻從火場旁出發，沿著海灣旁邊的山嶺去往高處，找視野更好的觀察點眺望目的地。他們的行動很快就取得了效果，按照約定從山頂打出一發信號彈，將偵察結果告知了在造船廠附近等消息的大部隊海灣盡頭的港口里并沒有他們所尋找的戰船，甚至連小舢板都沒有兩條。
這個偵察結果也印證了指揮官先前的猜測，對手在此之前就已經將本地的戰船調去了別的地方，只留給了明軍一處不設防的造船廠下手。雖然很順利地完成了這一階段的任務，但指揮官卻明白目前并未傷到對手元氣，還需要設法找到對手在島上的主要力量并加以消滅才行。
然而對于島上其他區域的狀況，明軍所得到的情報信息就極為有限了。他們手上只有海漢的軍用地圖，以及大致會有人聚居的區域，至于對手的武裝人員藏身何處，就只能慢慢現找了。
不過他們倒也不用完全依靠徒步來對整個島進行篩查，島上地形平坦的宜居地區基本都集中在幾塊臨海平原，乘船前往另外幾個待清查的區域要比徒步快得多。但這樣的地形也給他們的作戰目標帶來了不小的困難，雖然島上的武裝人員或許根本不是他們的對手，但僅靠登島這一千多明軍想對面積超過三百平方公里的福江島完成搜查，基本算是不可能完成的任務。
為今之計，也只能依托于水面艦艇的優勢，先對島上的幾處重點區域進行排查，能找到多少敵軍就盡力消滅多少了。
而此時在距離福江島大約二十里開外的奈留島海域，從聯軍艦隊分出的另一支小型艦隊正在對島上的一處海灣港口發動進攻。事實上偵察部隊所的資料只表明了這處海灣內有港口存在，但并不能確定島上是否有對手的武裝人員駐守。而聯軍則是抱著有棗沒棗都打一桿子的念頭，總之是先派人登陸上島，對人口聚居區進行一番搜查再說。
如果有人跳出來抵抗，那自然不用多說，就勢將抵抗者清理干凈便是。而軍方其實也很清楚，采取這種行動遭遇抵抗的可能性極大，畢竟五島列島在過去很長一段時間內都是倭寇老巢，定居在這里的民眾，即便本身不是倭寇，也與倭寇有著千絲萬縷的聯系，不太可能在外來勢力面前選擇乖乖就范。
相較于福江島，五島列島的另外四個主要島嶼的面積都小得多，而且島上的宜居區域加在一起都比不了福江島，因此常住人口數量也少得多。按照聯軍參謀部門的估計，除了福江島之外，另外幾個島上的人口規模應該都在千人以內，解決起來不會太棘手。
唯一比較麻煩的是這幾個島嶼的海岸線彎彎折折，有不少隱蔽的小型海灣，聯軍艦隊不得不分出若干小分隊，去分頭清理這些目標區域。
攻擊奈留島的部隊在登陸期間基本沒遇到像樣的抵抗，先頭部隊上岸之后，才有一伙持械浪人沖出來試圖將外來者逐出灘頭，但他們的武勇在火槍面前毫無發揮余地，將此作為熱身活動的特戰團士兵僅用一輪齊射便瓦解了浪人們虛張聲勢的攻勢。躲過這輪彈雨的幾個家伙意識到發生的狀況后，毫不猶豫地拋下了傷亡的同伙，頭也不回地逃走了。
這個小港口并沒有聯軍所期待遇到的戰船，岸邊只停泊著幾艘小漁船，看樣子這里也不會有太多敵人存在。
登陸的海漢軍以最快速度掃蕩了港口旁邊的漁村，或許是港口那些還沒涼透的浪人尸首起到了震懾作用，之后的行動沒有再遇到有組織的抵抗，三百多名本地民眾很快就從各自家中被驅趕出來，在港口集合到一起。而初步的搜查也并未從這些民宅中找到多少制式武器，搜到的幾把倭刀也都是銹跡斑斑，一看便知有年頭沒用過了。