楊廣接到懷戎叛亂的奏疏，當即心態就崩了。
楊廣素來寵信佛家，其交往的和尚也皆是道德彪炳的大師，實在難以想象一個和尚造反做皇帝。
這一個和尚，稱帝做天子，還娶了個尼姑做皇后，真是天下奇聞。這群和尚是不是吃飽了撐的啊，難道天天誦經焚香、打坐參禪不夠嗎。
楊廣是信奉佛家，但他信奉的是能夠幫他穩住天下民心、穩固統治的佛家，而不是要造反的佛家。他先是一個天子，然后才是一個佛教徒。
朝廷內外也炸了鍋了，實在是此事匪夷所思，駭人聽聞。
“和尚娶尼姑，這······這成何體統？”
“先有彌勒教，再有大乘國，這佛家之事，怕是實在不成體統了。”
······
作為宰相，再是沒多少實權，但實際上黃明遠手指縫里漏上一點，也能量巨大。這些日子，黃明遠便命人準備了不少關于僧侶作亂的事情上報給天子，不斷給予楊廣等人心理暗示，讓楊廣覺得佛教這些年來做的有些過了。而等到這一次先有定鼎門之亂，然后便是高曇晟之亂事發，終于激起絕大多數人對宗教的反感。
眾臣紛紛上表。
“圣人明鑒，這僧侶一道，良莠不齊，多有假借佛、道名目為非作歹之徒、愚弄百姓，禍害鄉里，而今日已到了不得不整治的地步。”
楊廣還是猶豫，這時黃明遠又趁機進言道：“圣人明鑒，今日整治佛、道骯臟、隱晦之種種丑惡，實為廣大佛、道之真善。若使二者并行，則真善勢必為丑惡所污染。佛、道不進行整治，則恐為邪教所據。”
佛教、道家到底發展到什么情況，其實楊廣也不清楚。只是當其所看到的和以往的認識出現分歧時，他本能的便會產生懷疑，便會尋求答案。等到黃明遠將佛、道的惡事在一樁樁、一件件擺到楊廣面前，他便會以為佛、道是故意蒙騙于他，他之前所認為的都是假的。
愛之深，便會恨之切。
雖然擔憂會平白生出波折，但楊廣最終還是不愿意使自己的統治重大隱患，因此決定整治佛、道兩家。
正月二十五日，楊廣下令，凡僧、道者，必有官方之度牒，無度牒者一概還俗；朝廷每三年對持度牒之僧侶進行考核，凡考核不過者一概收回其度牒；朝廷每年限量發放度牒，要成為僧、道者必須熟悉佛家、道家之典籍，文試不過者不得申請度牒；各地僧、道統一進入官方指定的寺廟、道觀修行，若是寺院、道觀破落不堪，便一律廢毀；各地拆廢寺院和銅像、鐘磬，所得金、銀、銅一律交付民部鑄錢，鐵則交付本郡鑄為農器，還俗僧侶各自放歸本籍充作國家的納稅戶；凡寺廟、道觀者之寺田，按人頭每人不允許超過十畝，凡多余者一律收歸官府所有；凡寺廟、道觀者不允許蓄奴······
后面這限田和禁奴是黃明遠提出來的，而且態度很堅決。黃明遠以為既然是做和尚、道士，就是為了修行，是為了尋大道。修行之人，不重錢財，不重口腹之欲，收租、蓄奴算是怎么回事。難道做和尚、道士是要人伺候的嗎？
朝廷對佛家、道家的整頓很迅速，很快便在全國范圍內發起了一場整治運動。