“造反了！造反了!”其余的公差，紛紛地舉起了鐵尺和刀。
樊崇掄起了他的鋤頭，一連打翻了三個公差，被鎖著的那些犯人，也都紛紛地掙脫了鎖鏈，幫著樊崇打了起來。不一會兒功夫，七個公差個個都去見閻王了。
一不做二不休，這幫犯人們，都跑回了各自的家里，把各自的那些不給吃飯的主人，都一、一地打死了。
打死了那么多的人，接下來怎么辦呢？根據當時的嚴苛的刑法，每個人都是要滅族的，還不如造反了吧？大家便公推樊崇為頭領，干脆扯起了大旗。數百人由樊崇領著頭轉戰在了泰山的腳下。
當時，青、徐二州大鬧饑荒，赤地千里、遍野盜賊。東海郡人徐宣、謝祿和楊音也各自起了兵，他們看到樊崇的勇猛，都歸順了樊崇的隊伍。不到三個月，樊崇的隊伍已經擴大到了數萬之眾了。
他們一起回攻了莒縣，但久攻未下，轉掠到了姑幕縣。遇到了王莽的探湯侯田況所帶領的軍隊，兩軍進行大戰，最后樊崇擊敗了田況，攻入了青州。由于樊崇的軍隊，都是饑民組成的烏合之眾，因此他們所過之處，都是燒殺搶掠。最后回到了秦山，駐扎在了南城縣。
樊崇越想越不對。他自己本是窮人出身，現在領著數萬人的大軍，到處燒殺搶掠，這跟土匪有什么兩樣，這不是有違自己造反的初衷的嗎？于是，他便召集了眾頭領，與大家一起約定，再有殺人者處死，再有傷人者償創傷。因為他們的軍隊里，沒有一個識字的人，因此都是用話語把命令往下傳遞著，沒有文書旌旗、沒有編制和號令。樊崇自號為三老，其余的屬下為從事，再往下便為卒吏。
王莽被震動了，他立刻派平均師廉丹、太師王匡率領著大軍，向樊崇的起義隊伍圍了過來。
樊崇準備迎敵了，但是他擔心，自己的軍隊與王莽的兵分不清楚怎么辦？于是他下令，所有的部下都把眉毛染成紅色，凡是眉毛黑色的人，一律進行攻擊，于是，赤眉軍便誕生了。
赤眉軍紀律嚴明，以泰山的周圍作為根據地，在青、徐二州間，來回地打擊著官府和那些積糧如山的富戶，搶糧來救災民。青、徐二州的百姓，因為連年的干旱和蝗災，連草根樹皮都吃不上，饑餓的農民到處流離、哀鴻遍野。樊崇看得傷心流淚，他不停地打擊著那些貪官污吏，不斷地開倉救民，得到了廣大百姓的擁護，他的隊伍也越來越壯大了。
公元21年，王莽派大將景尚，率領著一隊官兵，前來剿滅赤眉軍，赤眉軍和這隊官軍，來來回回地圍著泰山，邊繞圈子邊打著仗，整整打了一年的仗，赤眉軍終于打了一個大勝仗，擊殺了景尚，大敗了新莽的軍隊。
王莽大怒了，于公元22年，又派遣太師王匡，更始將軍廉丹，率領了十萬大軍，浩浩蕩蕩地殺奔了泰山。
赤眉軍一貫作戰勇猛，而且又深得百姓的愛戴，新莽軍每到一處的動向，百姓們便會自動地來到赤眉軍的營寨，向赤眉軍報告新莽軍的新的動向。最后在成昌，赤眉軍同王匡率領的新莽軍進行了決戰，在激戰中，樊崇一槍刺中了王匡的大腿，王匡不顧一切地奪路奔逃。而廉丹卻被另一名赤眉軍的首領董憲，一刀砍翻在了馬下。新莽軍滿山遍野地潰逃著，丟下了無以勝計的兵器、甲仗、戰馬、軍糧。赤眉軍經過這一次大戰，更加發展壯大了，他們已經擁有十多萬的大軍了。