控制了中央政權以后，董卓殘忍不仁的惡性便更加膨脹了，他的手下的士兵則更是四處劫掠、殘害百姓。
于是，便爆發了十八路諸侯，集義軍共討董卓的運動，在十八路諸侯的聯合打擊下，董卓抵擋不住，便率軍向西撤退，同時又劫持了漢獻帝和百官，并強迫所有的百姓，一起步行到長安，致使從洛陽到長安的一千多里的地面上，哀鴻遍野、積尸相銜。
董卓到達長安后，更是作惡多端，引起了公眾的憤怒，很多人都在密謀要誅滅董卓。其中最有力量的是司徒王允。
在三國演義中，王司徒巧使連環計，把自己的養女貂蟬獻給了董卓，并又讓貂蟬勾引了董卓的養子呂布。當然，三國演義是，在歷史上，貂蟬這個人是沒有的，而在本書中的過程卻是這樣的。
司徒王允，是漢朝的三公，他多次與尚書仆射士孫瑞、司隸校尉黃琬、尚書鄭公業等人，商議了誅滅董卓的計劃，但商量了許多次，都因為董卓戒備森嚴，而且還有著名的勇士呂布，擔任著他的貼身警衛，實在無從下手啊！
有一天晚上，王允在自家的庭院里仰望著天空，心里在想著自己的心思。忽然，天上徐徐地降下一個道者，他驚得一乍，趕忙趨步向前。
“王司徒請了。”那個道者開口說話了。
“請了！仙長！”王司徒見來人童顏皓首，雪白雪白的五絡長髯飄拂在了胸前。
“你是在想誅滅董卓的事情吧？”那個道者又問道。
“仙長真是什么都知道啊？我也不瞞你了，我的確在想誅滅董卓的事情，但百思不得其法呀？”王司徒回答。
“三日后的下午，董卓要在朝廷召集會議，我將在宮門外的大街上刺殺董卓，你們做好一切準備，在董卓死后迅速地控制住局勢，你能辦到嗎？”那名道長問。
“能，我能辦到！”王司徒激動地回答。
“那就一言為定，三日后宮門前相見。”那個道長說。
“遵命！”王司徒作了一個揖。
三日后，董卓坐著有頂無墻的馬車向皇宮中行去，他有三千虎賁軍護衛，閑人是近不得身邊的，呂布騎著馬，就緊緊地跟在了馬車的后面。
突然，有一名軍官騎著馬過來，他要求見呂布，呂布迎了上去。只見那位將軍，對呂布念了幾聲咒語，回過身去，提馬就走了。
呂布毫不猶豫地拎起了方天畫戟，直向董卓的馬車沖去，一戟刺中了董卓的喉嚨，董卓大叫一聲，奮力跳起。但呂布又一戟，刺向了董卓的腹部，董卓一跤摔下了馬車，摔在了長安的大街上，腸子流了一地。
這時，從天上飛下了一張紙，飄落在了董卓的臉上，紙上用朱筆寫著：“報應！第二個。”下面落款是“天公將軍”。
董卓被殺后，滿朝文武和所有的士兵，都高喊著萬歲。長安的百姓在大街小巷載歌載舞，共同慶祝國賊被誅，董卓死在了大街上，流了一地的肥油，有一個士兵，把點著了的一根捻子插入了董卓的肚子，于是董卓肚子上的長明燈便“光明達曙，如是積日”。
盡管王允迅速地控制了長安的局面，但董卓的部將李傕、郭汜，在一個月之后便攻入了長安城，于是，長安城又陷入了涼州軍的治制。