朱載坖聽完之后若有所思，說道：“嚴閣老之為政，亦與一般輔臣不同也。”
馬森說道：“是與華亭（徐階）、興華（李春芳）不同也。”
朱載坖屏退一切閑雜人等，請馬森明言，馬森也就直言不諱的說道：“王太倉還是太年輕了，只知其一不知其二也。”
馬森認為，現在的科權，其實并非科權，而是閣權的延伸罷了，六科憑什么能夠壓制六部，就是因為內閣支持六科，打擊部權，六科的所謂科權，其實都是內閣的意志。
現在對于首輔大人們來說，最重要的就是控制科道，徐階、李春芳為什么能夠坐穩首輔的椅子，除了簡在帝心之外，更重要的就是對于科道的把持，科道現在成了內閣的打手，所以從內閣的角度來說，科道的權力增加就是內閣的權力增加。
因為從本質上來說，科道和內閣一樣，都是沒有任何行政權力的，大明朝廷的行政權力都在六部手上，科道是監察，內閣只不過是皇帝的幕僚機關罷了，但是隨著時間的變化，內閣權力的上升，使得閣部之爭越來越激化，閣部之爭爆發之后，內閣的辦法就是用科道來制衡六部。
六科管住了六部，而內閣管住了六科，所以本質上不是六科的權力擴大，而是內閣的權力擴大，在嘉靖、嚴嵩時代，他們二位本就是極為強勢的主，六科自然不在他們的眼中，他們要親自掌握權力，而不是用其他人。
而輪到徐階就不是這樣了，徐階能上位，清流言官就是出了大力的，所以徐階對于言官是極為優容的，言官們也甘心為徐閣老當打手，李春芳也在言官隊伍中有大量的擁躉，所以他們二位很大程度上就是用言官在治國。
馬森極為憂慮的認為，祖宗設立六科，是為天子耳目，本是皇帝身邊的近侍機構，應該是皇權的延伸，現在卻成為了閣權的延伸，這才是最令人憂慮的。
所以馬森想請朱載坖大振乾綱，以自己請辭為契機，恢復舊制，徹底整頓六科，使六科回到皇權延伸的合理位置上來。
對于這位老臣的看法，朱載坖說道：“卿也不必如此啊！”
馬森說道：“陛下，事有取舍，方可為政，今陛下舍老朽一微末之臣，而為大明建百代之政，孰輕孰重，豈用臣言！”
朱載坖想了半天，才說道：“卿尚有何愿，朕可為卿處之。”
馬森笑著說道：“陛下，老臣生歸故里，鄉音無改，已是僥天之幸了，尚復敢有他言。”
馬森離開之后，朱載坖下旨，準允戶部尚書馬森致仕，加馬森少師兼太子太師，賜雙俸、馳驛，蔭一孫國子監生，遣錦衣衛護送回鄉。</p>