朱翊鈞選擇海瑞這個嚴格而又有能力的大理寺卿，使得巡回法庭成為大明最為風清氣正、冤假錯案最少的司法機構。截止萬歷九年底，八個巡回法庭已經在大明各省走了一個大圈，共糾正冤案六千八百余起，斷案三萬七千余例，總結整理了各種典型案例一千四百三十個，并促使朝廷修改《大明律》具體條文一百五十余處。
出于對司法權力制衡的考慮，皇帝并未授予巡回法庭在糾正錯案的過程中以督查官員之權。但巡回法庭每糾正一個錯案，必須將其中可能存在的**線索，按照該官員的被管理權限，移送給兩京都察院或地方按察司。
而巡回法庭移送的線索，都察院和按察司是必須給皇帝一個說法的，相應的報告必須移送巡回法庭簽閱。如此一來，就在案件糾察工作上形成一個完整的閉環，在海瑞的監督下，閉環各個環節上的魑魅魍魎都被反復滌蕩。
巡回法庭所到之處，大量冤假錯案被糾正，與之相關的**官員一串串、一窩窩的被隨之而來的都察繩之以法。
效果非常顯著，從萬歷七年開始，大明的吏治就為之一清。大量冤假錯案造成的民怨得到極大緩解，“官府衙門八字開，有理無錢莫進來”的情況也得到了很大糾正。
在朱翊鈞授意下，**官員一旦被查實，兩京各大報紙一般都會連發幾篇文章，將之徹底的釘在恥辱柱上。在以“孝”治國的國度里，此類曝光對當事人的打擊是致命的，是真正的社會性死亡。
后世的史學家研究，海瑞建立的巡回法庭絕不僅僅是法庭，而是掌握在朱翊鈞手中的反**利器。海瑞如同一柄絕世的神兵，其凜冽寒光所照，大明先是出現了點點凈土，隨即這些凈土連接成片，終于還給百姓一個朗朗晴天。后世的社會學家據此還發明了一個詞兒，叫做“海瑞效應”。
萬歷十年初，在南京巡回法庭總署過了年的海瑞再次出動，須發皆白的海青天出巡的第一站即放在杭州。因為萬歷十年的冬天，杭州下了一場歷年罕見的大雪。大量仍相信天人感應的杭州市民，都在傳說杭州一定是出現了大的冤案。
海瑞本人不相信天人感應之說，他盡管已經古稀之年，但因把學習當做重要的修身原則，一直能跟上形勢。他不僅不是一個食古不化的倔頭，還是一個與時俱進的能臣。報紙上普及的格物知識，海瑞是每期不落全看的。而且，他還緊跟時髦做剪報。
雖然不信天人感應之說，但民有所呼，我有所應。海瑞本來就打算在萬歷十年初就帶著第三巡回法庭出巡，將第一站選在杭州也就是順便——萬歷九年底，相關文函就被送到浙江布政使司，通知海大人明年第一站到杭州。
他這一順便不要緊，浙江布政使司的巡撫衙門、布政司、按察使和杭州知府以及所有縣官春節都沒過好，連續加班復核三年以來所有司法案件。凡是海瑞巡回法庭管轄范圍內的各類文案，都列出整改條目進行自查。
按照浙江巡撫吳善言的說法：“自查自糾盡管有失官僭，但在海大人面前至少爭取有一個好態度！不管是誰，膽敢掉鏈子，老子剝了你們的皮！”當然，吳巡撫并不能剝誰的皮，這里是將掉鏈子官員官衣剝掉的意思。巡撫要參自己的下屬，那還是一參一個準的。
經過連續兩個月的精心準備，杭州終于達到了海晏河清的境界。萬歷十年二月初三，到達杭州的巡回法庭放出告牌之后，法庭門外門可羅雀。
海瑞開始時還懷疑是不是杭州地方把進法庭的路給封了——此前就有個愚蠢的地方官這樣干過，還有的地方官安排人在海瑞面前“演官司”哩。他派了好幾撥人出去查看，結果反饋回來的消息是杭州市面一切如常，街頭巷尾打聽的結果是年節前后，整個浙江把積案都判決了，所有司法案件又復核了一遍。
海瑞啞然失笑，也不以浙江布政司這樣做為忤。海瑞覺得如果在自己有生之年能讓所經之地青天朗朗，那將是對他最大的褒獎，海剛峰死而無憾！